出售非法制造的抵扣税款罪的立案标准是：1、出售擅自制造的可以用于骗取出口退税、抵扣税款的非专用五十份以上的；2、出售擅自制造的可以用于骗取出口退税、抵扣税款的非专用票面额累计在二十万元以上的。法律依据：《刑法》第二百零九条第一款伪造、擅自制造或者出售伪造、擅自制造的可以用于骗取出口退税、抵扣税款的其他的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处二万元以上二十万元以下罚金；数量巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；数量特别巨大的，处七年以上有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。